一、本系學生畢業時需修滿至少140學分，包括：
- 通識教育：28學分
- 專業必修：82學分
- 專業選修：21學分
- 自由選修：9學分
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第一領域：基本語文能力（必修）
- 次領域一：中國語文知識及應用（4學分）
- 次領域二：外語能力訓練
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| 第二領域：數理能力（得免修） |
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二年級 |
- 材料力學（二）：3學分
- 熱力學（二）：3學分
- 視窗程式設計：3學分
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三年級 |
- 流體力學（二）：3學分
- 機器動力學：3學分
- 機械振動學：3學分
- 製造自動化概論：3學分
- 自動控制（二）：3學分
- 固力專題研究（一）：2學分
- 熱流專題研究（一）：2學分
- 設計製造專題研究（一）：2學分
- 自動控制專題研究（一）：2學分
- 生物機械力學：3學分
- 生物流體力學：3學分
- 生物微機電系統實驗：3學分
- 磨潤原理與應用：3學分
- 高等材料力學：3學分
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四年級 |
- 生物機械力學：3學分
- 精密機械概論：3學分
- 固力專題研究（二）：2學分
- 熱流專題研究（二）：2學分
- 設計製造專題研究（二）：2學分
- 自動控制專題研究（二）：2學分
- 光學實驗：1學分
- 數值方法：3學分
- 數位訊號處理：3學分
- 生物微機電系統：3學分
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- 電腦輔助幾何設計：3學分
- 電腦輔助機械製造：3學分
- 雷射加工導論：3學分
- 振動控制：3學分
- 精密量測：3學分
- 工程分析（一）：3學分
- 工程分析（二）：3學分
- 實驗應力分析：3學分
- 連續體力學：3學分
- 有限元素分析：3學分
- 品質工程：3學分
- 線性系統：3學分
- 銲接工程概論：3學分
- 電腦控制製造系統：3學分
- 電動機動力與控制：3學分
- 內燃機設計：3學分
- 數位控制系統設計：3學分
- 中等熱傳學：3學分
- 聲學：3學分
- 振動噪音量測：3學分
- 中等熱力學：3學分
- 中等流力學：3學分
- 精密機械設計與實習：3學分
- 微奈米機電系統原理與應用：3學分
- 微/奈米機電系統實驗：3學分
- 塑膠精密加工：3學分
- 複合材料力學：3學分
- 觀測器理論：3學分
- 微光學技術：3學分
- 非線性系統分析：3學分
- 最佳化控制：3學分
- 邏輯系統設計：3學分
- 半導體封裝工程技術概論與實務介紹
- 控制器程式
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- 自由選修科目可修本學系專業課程，亦可選修其他學系課程。超修之通識教育課程，不得計入畢業學分。
- 本學系學生選修軍訓（護理）課程之學分數，不得納入自由選修及畢業學分。
- 放棄教育學程或超修教育學程之學分，得轉認列為自由選休學分。
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